La particularité et surtout l’originalité de notre Centre Thermal provient de son eau salifère, bromée et iodique qui coule, brûlante, dans le sous-sol euganéen.
Dans les Préalpes, à 1000-1500 mètres d’altitude, l’eau de pluie s’infiltre dans le sous-sol jusqu’à une profondeur de 2500-3000 mètres, en se chargeant de sels minéraux et en se réchauffant progressivement.
Il lui faut plus de 25 ans pour parcourir 70-100 kilomètres, distance qui la sépare du territoire euganéen où, grâce aux conditions structurelles particulières du sol, elle effectue une remontée rapide à la surface, en maintenant quasi intactes sa température élevée (70° C – 87° C) et sa salinité
 
Cette eau est principalement utilisée aux Thermes d'Abano pour la maturation, la conservation et la régénération de la boue thermale.
 
Riche en oligo-éléments, prélevée au fond d’un petit lac d’origine volcanique sur les Monts Euganéens, débarrassée de ses impuretés, rendue mature en eaux thermales, la boue de nos thermes désintoxique, est anti-inflammatoire et décongestionne en profondeur. Qui plus est, elle stimule et oxygène le sang et les tissus, procurant énergie et vitalité.         
La composition chimique et la température de l’eau agissent de façon déterminante sur l’efficacité thérapeutique de la boue et dans le développement de la microflore singulière, végétale (algues) et animale (micro-organismes), qui se forme pendant le processus de maturation de l’argile.
Lors de ce processus, l’argile est progressivement colonisé par les nombreuses micro-algues (Diatomées et Cyanophycées) présentes dans l’écosystème qui caractérisent le Bassin Thermal Euganéen et confèrent à la boue de précieuses propriétés chimiques, physiques et thérapeutiques.
 
Notre boue est incubée pendant deux mois au moins en présence d’un flux continu d’eau thermale, processus au cours duquel elle est abondamment colonisée. Parmi les principaux micro-organismes colonisateurs se trouvent certaines cyanobactéries, dont l’une des plus importantes et florissantes appartient au genre Phormidium. Isolée pour la première fois dans nos boues et longuement analysée, elle produit une action anti-inflammatoire élevée caractérisée par l’absence d’effets secondaires, même après des traitements répétés.